© Dominique Tcherdyne 2004 - dtcherdyne@bluewin.ch

Vers 1811, Naef fait un stage de formation à Paris, dans l’Institut de l’abbé de l’Epée, renommé dans l’Europe entière.

A son retour de Paris, Naef reçoit un nouvel élève, le jeune Constant de Goumoëns. Il s’engage à lui donner une éducation religieuse « indispensable à tout honnête homme ». Grâce aux succès qu’il obtient avec ses deux élèves et aux articles de presse, plusieurs parents du canton de Vaud, de France voisine et de Suisse allemande lui confient leur enfant sourd-muet.

Alors il fonde le 1^er juillet 1813 un Institut spécialisé et indépendant de celui du château, avec le plein accord de Pestalozzi.

Peu après son mariage en 1815 avec une Yverdonnoise, Charlotte Scherer, il installe son Institut dans sa propre maison à la rue de la Plaine (actuellement le No 39), accueille aussi des filles, fait construire une annexe dans le jardin pour la classe et le dortoir des garçons. Un maître, Johann Walder, vient seconder Naef ; il restera fidèle à l’institution toute sa vie.

Le professeur André Gindroz de Lausanne rapporte dans la Feuille du canton de Vaud :     « … Cultiver son intelligence en l’enrichissant de connaissances utiles, en dirigeant son activité vers tout ce qui est bon et vrai, lui inspirer des sentiments purs, élevés et bienveillants, voilà la tâche que M. Naef s’est imposée. »